بر این اساس حسین خنیفر به اتفاق آراء و تائید شورای عالی انقلاب فرهنگی پس از سه سرپرست پیشین دانشگاه و با گذشت 147 روز سرپرستی به عنوان "اولین رئیس دانشگاه فرهنگیان" منصوب شد.
متن حکم وزیر آموزش و پرورش به این شرح است:
برادر ارجمند جناب آقای دکتر حسین خنیفر
نظر به تععهد، تخصص و تجارب ارزشمند و مراتب علمی جنابعالی و به استناد ماده 10 اساسنامه دانشگاه و مصوبه بیست و پنجمین جلسه کمیته منتخب تایید صلاحیت روسای دانشگاهها مورخ 26 فروردین 97 شورای عالی انقلاب فرهنگی، به موجب این حکم به مدت چهار سال به عنوان "رئیس دانشگاه فرهنگیان" منصوب میشوید.
امید است در پرتو توجهات ایزد منان و پیروی از منویات گهربار مقام معظم رهبری و سیاستهای رئیس جمهور و در چارچوب سیاستها و برنامههای اینجانب به مجلس شورای اسلامی نسبت به انجام وظایف محوله موفق و موید باشید.
انتظار میرود با مشارکت اساتید، صاحبنظران، کارکنان و دانشجومعلمان عزیز و تعامل سازنده با مسئولین محترم وزارت علوم، تحقیقات و فناوری و مدیران دانشگاه های سراسر کشور، شاهد تحولات و نوآوری کمی و کیفی در نظام تربیت معلم کشور بر اساس سند تحول بنیادین وزارت آموزش و پرورش باشیم.
توفیق جناب عالی را در انجام مسئولیتها در راستای نظام جمهوری اسلامی و دولت تدبیر و امید از خداوند منان مسئلت دارد.
شایان ذکر است به استناد اساسنامه این دانشگاه، صدور حکم رئیس دانشگاه منوط به پیشنهاد وزیر آموزش و پرورش، تأیید وزیر علوم، تحقیقات و فناوری و تصویب شورای عالی انقلاب فرهنگی است که شورای عالی انقلاب فرهنگی در جلسه پیشین خود، انتصاب دکتر خنیفر به ریاست دانشگاه را تصویب کرده بود.
حسین خنیفر به عنوان چهارمین سرپرست دانشگاه در تاریخ 20 آذر 1396 از سوی وزیر آموزش و پرورش به عنوان سرپرست دانشگاه فرهنگیان منصوب شده بود.
پیش از این اسدالله اسدی گرمارودی، جهانبخش محبی نیا و محمود مهر محمدی سرپرستی این دانشگاه را به عهده داشتند.